纤维集成光学可以视为是集成光子学的一个新分支，其内涵是研究集成在一根特种微结构光纤中的光子学器件和光子系统的理论、方法、技术及其应用，主要内容包括:(1)特种微结构光纤;(2)纤维集成光器件与微系统；（3）纤维光子微动力学的基础理论、关键技术与应用等方向开展研究工作。

   本实验室的科学研究目标是：建设纤维集成光学学科新分支，发展纤维光子集成的相关理论、方法与关键技术，为无源、有源以及混合全光子集成探索一条自主创新的新方法和新途径；发展折射率导引型微结构光纤光学的基础理论与关键技术；开展纤维集成光器件与微系统及其应用，为微型、特种光子信息获取、传输与处理提供新方法与新手段；发展纤维光子微动力学，为光子微操控及其应用提供新原理和新途径；形成一系列标志性的创新成果，整体水平达到国内领先、国际先进水平。